Knowledgebase – ER Biotech

No	Ürün Açıklaması
1.	11cm, pH 3-10, ProteoGel IPG Strips (non lineer)
2.	11cm, pH 4-7, ProteoGel IPG Strips
3.	11cm, pH 6-10, ProteoGel IPG Strips
4.	Striplere Uygun Ampholit (Ph 3-10)
5.	Striplere Uygun Ampholit (Ph 4-7)
6.	Striplere Uygun Ampholit (Ph 6-10)
7.	SDS
8.	Üre
9.	Tiyoüre
10.	Low melting agaroz
11.	DTT
12.	Trisma
13.	Glisin
14.	Gliserol
15.	Akrilamid
16.	Bis akrimlamid
17.	APS
18.	TEMED
19.	Bradford reaktif
20.	Coomassie brillant blue G-250
21.	Brom fenol blue
22.	Aseton
23.	n-butanol
24.	TCA
25.	BSA
26.	CHAPS
27.	Proteaz inhibitörü
28.	IAA
29.	PBS
30.	Mineral oil

Kuantum Verimliliği (Quantum Efficiency – QE) Nedir ?

ER Biyotek — Mon, 25 May 2020 12:44:36 +0000

CCD Kameranın Kuantum Verimliliği Nedir ? Neden Önemlidir ?

Sensör teknolojisinde verimlilik faktörü olarak kullanılan quantum efficiency (QE) özetle birim zamanda sensör üzerine düşen fotonların, elektrona dönüştürülme oranı olarak tanımlanır.

Formüle edilmek istenirse Qe = e-/ph olarak tanımlanır. Burada;

ph : sensöre düşen toplan foton sayısı
e- : dönüştürülen toplam elektron sayısıdır.

Dolayısıyla, verimi yüksek bir sensörde en önemli unsur; sensör üzerine düşen fotonların olabildiğince fazlasını elektrona (akım) çevirebilmektir. Bu da, gelen fotonların, geriye yansıma olmaksızın, tamamını fotodiyot üzerine düşürebilmek ve fotodiyot üzerinden akıma çevirebilmek anlamına gelir.

Günümüzde yaygın olarak kullanılan sensörler Ön Yüzeyden Aydınlatma (Front Side Illumination) olarak bilinen sensörlerdir, bu sensörlerde yapı sırasıyla (ve özetle) Mikrolens – Renk Filtresi – Metal İletkenler – Fotodiyot şeklindedir.

Yüksek kuantum verimi kısa pozlama sürelerinde bile hassas görüntü elde edilmesini sağlar, yeni nesil bilimsel CCD kameraların kuantum verimleri %90‘a ulaşmaktadır.

GEN-BOX imagER CFx Kemilüminesan Görüntüleme Sistemleri yüksek kuantum verimine sahip bilimsel kameralar kullanmaktadır;

Yüksek kuantum verimine sahip soğutmalı bilimsel CCD kamera ile alınmış blot görüntüsü.

Pozlama Süresi (Exposure Time) Nedir ?

ER Biyotek — Mon, 25 May 2020 12:15:58 +0000

Pozlama Süresi Nedir ?

Pozlama süresi, film veya sensör üzerinde biriktirilen ve kaydedilen ışık miktarıdır. En iyi görüntüyü yakalayabilmek için doğru pozlama önemlidir, yüksek sinyaller için pozlama süresi düşürülür. Jel bantlarının kuvvetli UV ışık altında görüntülenmesinde bu süre birkaç saniyeyi geçmezken, western blot çalışmalarında düşük miktardaki proteinler zayıf sinyal verdiği için pozlama süresi bazen 10-20 dakikaya kadar arttırılır.

Eğer gereğinden yüksek bir pozlama süresi ile görüntü alırsanız, normal ve gerçek değerinden uzaklaşan çok parlak görüntüler alırsınız, bu sorunu önlemek için Gen-Box imagER Fx jel görüntüleme sistemlerinde saturasyon kontrolünü sağlayan bir fonksiyon bulunur, gerçek zamanlı görüntü üzerinde aşırı parlak bantları kırmızıya boyayarak sizi uyarır (bu kırmızılıklar alınan fotoğrafa işlenmez), bu sınıra geldiğinizde görüntü alma vakti gelmiş demektir.

İris (diyafram açıklığı), bantların parlaklığını etkileyen bir diğer fonksiyondur, yani sensöre ne kadar ışık ulaşacağını kontrol etmektir. Western blot çalışmalarında maksimum iris açık olması gerekirken, jel görüntülemede düşük iris/diyafram açıklığında daha uzun pozlama ile daha güzel görüntüler elde edersiniz.

Jel: İris kısıldıktan sonra 4 SANİYE pozlama süresi ile alınmış Agaroz Jel Görüntüsü (Boya: GelRed)

Blot: İris tamamen AÇIK konumdayken 5 DAKİKA pozlama süresi ile alınmış Nitroselüloz Membran Görüntüsü (HRP: ECL)

Bilimsel Kameraların Sensörü Neden Soğutulur ?

ER Biyotek — Mon, 25 May 2020 11:47:53 +0000

Bilimsel Kameraların Sensörü Neden Soğutulur ?

Kamera sensörüne ışık fotonları ulaştığında elektriksel sinyale dönüştürülür, bu işlem kameranın sensörünün ısınmasına neden olur, ısınan sensör üzerinde sıcak piksel lekeleri (hot pixels) oluşmasına neden olur, bunlar ortalamadan daha yüksek karanlık akımına sahip sahte gürültü pikselleridir.

Sensörün soğutulması sayesinde, sensör içinde bu tür sıcak piksellerin oluşumunu önemli ölçüde en aza indirilir, bu istenmeyen lekeleri engellemek için kameranın sensörü çok düşük sıcaklıklara soğutulur, en etkin kullanılan popüler soğutma tipi peltier soğutma sistemidir, fan kullanılan bu sistemde yarı iletken malzeme kullanılır ve sensör sıcaklığı – 60 C’ye kadar düşürülebilir.

Western Blot görüntüleme çalışmalarında filtre ve boya kullanılmadığı, sadece numuneden yayılan ışık yakalandığı için sıcak piksel lekelerini sensörü soğutarak engellemek şarttır.

Isınan yüzeyden yayılan sıcak piksel lekelerinin peltier sensör soğutma sistemi ile engellenmesi.

GEN-BOX imagER CFx Sistemiyle alınmış blot görüntüsü (- 60 C Sensör Soğutma Kapasitesi)

Gen-Box imagER ile Jel Görüntüleme

ER Biyotek — Mon, 25 May 2020 11:41:22 +0000

Gen-Box imagER ile Jel Görüntüleme Nasıl Yapılır ?

En güzel jel görüntüleri için aşağıdaki adımları takip ediniz;

Ön kontroller;

Cihaz ve bilgisayarın güç kablolarını kontrol ediniz.
Cihazdan çıkıp bilgisayara ulaşan 2 adet USB kablonun takılı olduğundan emin olunuz.
Önce cihazın güç düğmesini açınız, sonra imagER Eyes görüntü yakalama programını çalıştırınız.

Yazılım kullanım adımları;

1. Yazılım giriş ekranından kullanıcı seçiniz. (Varsayılan kullanıcı olan ‘Misafir’ hesabını kullanabilir veya yeni bir isim ve şifre ile kendi hesabınızı oluşturabilirsiniz, cihaza hangi kullanıcı ile giriş yaparsanız alınan tüm görüntüler otomatik olarak o kullanıcıya ait klasöre arşivlenecektir)

2. Jel Görüntülemeyi seçiniz.

3. Cihazın kapısını açınız, Transilüminatörün üzerine jelinizi yerleştiriniz.

4. Kullandığınız boyayı seçiniz ve devam ediniz, ana ekranın açılmasını bekleyiniz.

Sistem otomatik olarak uygun ışık kaynaklarını ve emisyon filtresini seçerek jel görüntüsünü gerçek zamanlı olarak ekranda gösterecektir.

5. FOKUS (netlik) ayarını daha hızlı yapabilmek için; POZLAMA Süresini azaltılır ve İRİS biraz açılır. (Pozlama süresini düşürmeniz kameranın ekranı yenilenme hızını arttıracağı için daha akıcı bir şekilde FOKUS ayarını yapmanızı sağlayacaktır)

Motorize sistemlerimizde FOKUS yazılım üzerindeki ayar tuşları ile (+) ve (-) butonları ile yapılır, ince ayarı kaçırmamak ve netlik değişimini görebilmeniz için birkaç tıklamadan sonra ön izleme ekranındaki değişimi izlemenizi tavsiye ederiz, ekrandaki görüntü en net halini aldığından fokus (odak) ayarınız tamamlanmış demektir. Bilgisayar kontrollü motorize zoom lenslere sahip sistemlerimizde jeli ekrana yerleştirmek için zoom (+) ve (-) butonları, manuel sistemlerimizde lensin orta bölümündeki ayar çemberi kullanılır.

6. Fokus (Netlik) ayarı bittikten sonra POZLAMA süresi ayarına geçilir. Daha önce açılan (arttırılan) İRİS biraz kısılarak POZLAMA süresi arttırılır ve ideal görüntüye ulaşılır.

Jelinizin kalınlığına ve kullandığınız boyaya göre pozlama süresi değişecektir, ilk optimizasyonda bu üreyi 2 veya 3 saniyeye ayarlayıp İRİS’i kullanarak beklediğiniz görüntüye ulaşabilirsiniz, bu arada sol alt bölümdeki SATURASYON kontrolünü açınız, bu özellik normalin dışında bir parlaklık oluştuğunda bantları kırmızıya boyayarak sizi uyarır, sınıra yakın pozlama süresi kullanmanızı tavsiye ediyoruz.

7. Ekrandaki görüntüyü kayıt altına almak için ekranın alt orta bölümde bulunan GÖRÜNTÜ AL küresine tıklanır ve görüntü alma işlemi başlatılır.

8. Elde edilen resim veya resimler seçilir ve KAYIT EDİLİR. (Program her ihtimale karşı alınan tüm görüntülerin otomatik yedeğini alır, bu sayede hiçbir veri kaybı olmaz)

9. Analiz programına aktarılarak ANALİZ EDİLİR.

Not: Blot görüntülemede TAMAMEN AÇIK İRİS ve uzun pozlama süresi ile, jel görüntülemede ise tam tersine KISIK İRİS ve ARTTIRILMIŞ POZLAMA süresi ile en ideal görüntüleri elde edebilirsiniz;